Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccbe1Q3MI99 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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