Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Rpusd3Q14AI6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rpusd3Q14AI6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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