Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Traf3ip1Q149C2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Traf3ip1Q149C2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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