Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VgfQ0VGU4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms