Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rundc1Q0VDN7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms