Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Vps8Q0P5W1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms