Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spata18Q0P557 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spata18Q0P557 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms