Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TrioQ0KL02 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms