Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
1700061G19RikQ08EE8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms