Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Siah1bQ06985 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Siah1bQ06985 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms