Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtprgQ05909 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms