Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Gm26836-201ENSMUST00000181056 1568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sox12Q04890 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sox12Q04890 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms