Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Emx1Q04742 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms