Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Thbs2Q03350 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Thbs2Q03350 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms