Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Runx1Q03347 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms