Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna1sQ02789 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms