Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ctnnb1Q02248 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ctnnb1Q02248 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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