Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Top2aQ01320 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Top2aQ01320 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms