Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gja5Q01231 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gja5Q01231 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms