Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Serpina1cQ00896 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Serpina1cQ00896 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms