Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HmmrQ00547 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms