Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms