Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Taf1bP97358 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms