Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pkp1P97350 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pkp1P97350 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms