Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Irx3P81067 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms