Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
RhobP62746 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
RhobP62746 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RhobP62746 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms