Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lmo4P61969 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms