Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppfia3P60469 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms