Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Paxbp1P58501 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Paxbp1P58501 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms