Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Setd4P58467 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms