Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Cldn18P56857 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms