Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irf5P56477 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Irf5P56477 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irf5P56477 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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