Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gp1bbP56400 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms