Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ephb4P54761 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ephb4P54761 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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