Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rad23aP54726 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms