Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RabggtbP53612 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RabggtbP53612 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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