Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ercc3P49135 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms