Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Abcd1P48410 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms