Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
VdrP48281 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
VdrP48281 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
VdrP48281 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VdrP48281 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms