Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gbx2P48031 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gbx2P48031 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms