Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pax9P47242 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pax9P47242 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms