Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc2P43407 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc2P43407 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc2P43407 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc2P43407 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdc2P43407 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Sdc2P43407 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sdc2P43407 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sdc2P43407 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sdc2P43407 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Sdc2P43407 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sdc2P43407 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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