Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ItgavP43406 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms