Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfsf9P41274 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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