Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TtlP38585 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
TtlP38585 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms