Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ddit3P35639 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms