Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab20P35295 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab20P35295 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms