Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Ptk2P34152 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ptk2P34152 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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