Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Hoxc5P32043 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Hoxc5P32043 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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