Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Cd28P31041 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cd28P31041 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cd28P31041 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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